生命科學(xué)學(xué)院遇赫研究組揭示中國(guó)家豬的起源傳播與人群互動(dòng)過(guò)程
2025年9月25日，北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、基因功能研究與操控全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室遇赫研究組聯(lián)合國(guó)內(nèi)外合作團(tuán)隊(duì)在Molecular Biology and Evolution期刊在線發(fā)表研究論文“Ancient genomics reveals the origin, dispersal and human management of East Asian domestic pigs”。該研究共獲取了來(lái)自全國(guó)14個(gè)遺址、距今約8000至800年的21份古代豬核基因組，是迄今首個(gè)東亞家豬的大規(guī)模古代核基因組數(shù)據(jù)集，為系統(tǒng)解析中國(guó)家豬的演化歷史提供了重要參考（圖1）。
圖1. 本研究所獲取的古代基因組地理分布
家豬的馴化是人類農(nóng)業(yè)社會(huì)建立和發(fā)展的重要里程碑。在新石器時(shí)代早期，家豬在亞歐大陸兩端被獨(dú)立馴化。作為家豬的主要起源地之一，中國(guó)擁有近百個(gè)本土豬品種，是全球家豬遺傳多樣性的重要組成部分。然而長(zhǎng)期以來(lái)，中國(guó)家豬的馴化與傳播歷史、與人群的互動(dòng)關(guān)系，以及關(guān)鍵表型的起源和擴(kuò)散過(guò)程仍不清晰。
研究聚焦于中國(guó)家豬的主要起源地——北方地區(qū)，探究其跨越數(shù)千年的種群動(dòng)態(tài)，證明了北方家豬的本地起源和此后數(shù)千年的遺傳連續(xù)性。研究還在基因組數(shù)據(jù)中，觀察到了距今約5000年前開(kāi)始家豬遺傳多樣性的顯著下降，并出現(xiàn)了人類控制繁殖導(dǎo)致的近交信號(hào)，與考古學(xué)證據(jù)體現(xiàn)的家豬管理模式向集約化轉(zhuǎn)變現(xiàn)象相吻合。這反映了人類管理模式對(duì)家豬遺傳構(gòu)成的深遠(yuǎn)影響，也為理解家養(yǎng)動(dòng)物遺傳多樣性變化提供了新視角，提示其背后的機(jī)制有待未來(lái)深入探討。
在馴化之后，北方家豬廣泛傳播，奠定了我國(guó)各地現(xiàn)生家豬品系的遺傳基礎(chǔ)。研究發(fā)現(xiàn)，我國(guó)西南地區(qū)的古代家豬由北方傳入，而非本地馴化，質(zhì)疑了這一地區(qū)同樣有本土家豬起源的可能性。在長(zhǎng)江下游地區(qū)，現(xiàn)生家豬品系與北方古代家豬之間遺傳上高度相似，卻與長(zhǎng)江下游當(dāng)?shù)卦缙诩邑i缺乏遺傳聯(lián)系，提示北方家豬向長(zhǎng)江下游的擴(kuò)散傳播。結(jié)合考古學(xué)和古人類基因組學(xué)的證據(jù)，研究團(tuán)隊(duì)指出，北方家豬的傳播路徑與北方粟黍農(nóng)業(yè)人群的遷徙軌跡高度一致，體現(xiàn)了家豬作為與農(nóng)業(yè)緊密相關(guān)的物種，其遷徙傳播與人類流動(dòng)具有同步性。
本研究還追溯了中國(guó)家豬黑毛表型的起源與傳播過(guò)程。結(jié)果顯示，該表型最早出現(xiàn)在距今約5300年的北方家豬個(gè)體中。隨著北方家豬馴化程度不斷加深，黑毛表型被逐步固定下來(lái)，并隨北方家豬的廣泛傳播擴(kuò)散至全國(guó)各地。
綜上，本研究系統(tǒng)描繪了東亞家豬的馴化和遷徙傳播圖譜，從遺傳上確認(rèn)了我國(guó)北方是家豬的獨(dú)立馴化中心，否定了西南地區(qū)存在獨(dú)立馴化家豬的觀點(diǎn)，并揭示了家豬與粟作農(nóng)業(yè)人群之間緊密的互動(dòng)關(guān)系，為理解東亞家豬的演化歷史提供了寶貴參考（圖2）。未來(lái)基于更高時(shí)空分辨率樣本的研究，研究人員將進(jìn)一步細(xì)化區(qū)域間的互動(dòng)過(guò)程，并為東亞家豬的馴化與傳播歷史提供新的見(jiàn)解。
圖2. 東亞家豬起源與傳播過(guò)程示意圖
北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士后韓雨與前沿交叉學(xué)科研究院PTN項(xiàng)目博士生趙致晗為本文共同第一作者。遇赫與牛津大學(xué)考古學(xué)院Greger Larson教授為本文的通訊作者。
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